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    snapgene如何設(shè)計引物(如何設(shè)計引物)

    2022-08-30 08:25:58 來源: 用戶: 

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    1、一般是通過設(shè)計軟件,例如oligo6,primer5等,你可以在網(wǎng)上搜一下引物設(shè)計軟件下載和使用說明,是比較容易的。

    2、至于設(shè)計引物的一般原則如下:* 序列選取應(yīng)在基因的保守區(qū)段* 避免引物自身或與引物之間形成4個或4個以上連續(xù)配對,避免引物自身形成環(huán)狀發(fā)卡結(jié)構(gòu) * 典型的引物18到24個核苷長。

    3、引物需要足夠長,保證序列獨特性,并降低序列存在于非目的序列位點的可能性。

    4、但是長度大于24核苷的引物并不意味著更高的特異性。

    5、較長的序列可能會與錯誤配對序列雜交,降低了特異性,而且比短序列雜交慢,從而降低了產(chǎn)量。

    6、* Tm值在55-65℃(因為60℃核酸外切酶活性最高),GC含量在40%-60%* 引物之間的TM相差避免超過2℃* 引物的3’端避免使用堿基A,引物的3’端避免出現(xiàn)3個或3個以上連續(xù)相同的堿基* 為避免的擴增,引物設(shè)計最好能跨兩個外顯子。

    7、* Taqman探針PCR要求片段長度在80bp-150bp * 引物末端(最后5個核苷酸)不能有超過2個的G和C。

    本文到此分享完畢,希望對大家有所幫助。

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