新研究繪制了野生動(dòng)植物微生物群圖
臨床前階段的藥物發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)公司W(wǎng)ild Biotech從隱身模式中脫穎而出,今天宣布發(fā)表其第一篇主要論文,該論文發(fā)表在《科學(xué)》雜志上。這項(xiàng)研究以前所未有的規(guī)模繪制了野生動(dòng)物腸道菌群的圖譜,并在該公司已經(jīng)龐大的數(shù)據(jù)庫(kù)中添加了數(shù)百萬(wàn)種基于新型微生物組的人類疾病治療劑。Wild將利用這些發(fā)現(xiàn)首先利用其數(shù)據(jù)庫(kù)查找炎癥,免疫和胃腸道疾病的靶標(biāo)。
Wild Biotech聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官Neta Raab表示:“在這項(xiàng)研究中,我們從野生的近200種動(dòng)物中收集了腸道菌群,涵蓋了不同的類別,進(jìn)食行為,地理和性狀。“通過(guò)使用從頭基因組大會(huì),我們構(gòu)建了一個(gè)動(dòng)物的5,000多個(gè)微生物基因組的數(shù)據(jù)庫(kù),并對(duì)其進(jìn)行了功能注釋,這些數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了1200多種細(xì)菌,其中75%以前是未知的。”
野生動(dòng)物表現(xiàn)出非凡的生存壯舉。從鬣狗和jack狼到塔斯馬尼亞惡魔,有些食物仍以腐爛,病原體感染和有毒食物為食,同時(shí)保持對(duì)疾病的免疫力-可能部分是由于它們的腸道菌群所致。雖然對(duì)這些生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的多樣性和功能的了解不多,但是動(dòng)物微生物群的微生物組成,多樣性和功能含量與動(dòng)物分類,飲食,活動(dòng),社會(huì)結(jié)構(gòu)和壽命之間存在已知的關(guān)聯(lián)。拉伯說(shuō):“這些是我們可以利用的線索,以發(fā)現(xiàn)治療人類疾病的全新藥物。”
《科學(xué)》雜志報(bào)道的發(fā)現(xiàn)為Wild獨(dú)特的動(dòng)物微生物群數(shù)據(jù)庫(kù)增加了3000萬(wàn)個(gè)基因(每個(gè)代表一種潛在的新型治療劑),該數(shù)據(jù)庫(kù)現(xiàn)已包含數(shù)百種動(dòng)物物種和1億個(gè)基因。Raab說(shuō):“大多數(shù)基因組材料都是新穎的,我們的數(shù)據(jù)庫(kù)將數(shù)千種以前未描述的物種引入了細(xì)菌的生命之樹(shù)。”
Wild使用最先進(jìn)的AI工具來(lái)解密其數(shù)據(jù)庫(kù)的治療潛力,并識(shí)別對(duì)人類疾病目標(biāo)具有直接活性的蛋白質(zhì),肽,噬菌體和其他藥物。該公司的數(shù)據(jù)庫(kù)之所以獨(dú)特,是因?yàn)榕c海洋或土壤中的微生物不同,動(dòng)物的腸道菌群與人類的治療藥物最相關(guān),可直接轉(zhuǎn)化為人類的治療藥物。
Wild Biotech的數(shù)據(jù)庫(kù)和AI工具得到高通量合成生物學(xué)的補(bǔ)充,可以驗(yàn)證微生物組來(lái)源的制劑并將其加速進(jìn)入臨床前測(cè)試,并且從微生物基因組中提取的高質(zhì)量數(shù)據(jù)使該公司可以直接合成和測(cè)試制劑。例如,在科學(xué)研究團(tuán)隊(duì)合成從腐肉食先前未描述的酶的面板微生物群,并表明它們對(duì)一系列微生物毒素操作,這表明了一種機(jī)制,排毒腐肉其由宿主動(dòng)物安全食用。
該公司還在其數(shù)據(jù)庫(kù)中確定了2,000多個(gè)CRISPR / Cas基因組編輯系統(tǒng),其中大約三分之一不屬于任何已知的CRISPR / Cas家族。
Wild公司領(lǐng)先的制藥行業(yè)專家兼顧問(wèn)John Baldoni博士說(shuō):“與其他公司不同,頑固性疾病需要對(duì)干預(yù)進(jìn)行新的思考。Wild建立了一種革命性的方法和工具來(lái)探索其新穎的數(shù)據(jù)集。” “您必須擁有數(shù)據(jù)才能進(jìn)行計(jì)算工作。由于它們的高度發(fā)展和相關(guān)的庫(kù),他們能夠在幾天之內(nèi)快速查看數(shù)百萬(wàn)種相互作用,并篩選和定位邏輯治療區(qū)域。Wild的方法可實(shí)現(xiàn)可翻譯的從微生物組數(shù)據(jù)到與復(fù)雜疾病相關(guān)的分子機(jī)制的工作流程。”
Raab說(shuō):“我們正在平衡創(chuàng)新和臨床證據(jù),以篩選與人類疾病相關(guān)的特定目標(biāo)的數(shù)百萬(wàn)種相互作用。” “我們對(duì)于數(shù)據(jù)庫(kù)中潛在的巨大潛力感到非常興奮,該潛力可用于確定全新的疾病治療方法。”
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