點(diǎn)擊倒帶來預(yù)測多步化學(xué)反應(yīng)
你有沒有只看到一個(gè)電視節(jié)目的結(jié)尾,想知道故事是如何發(fā)展到那個(gè)結(jié)局的?以類似的方式,化學(xué)家通常會(huì)想到一個(gè)想要的分子,并想知道什么樣的反應(yīng)可以產(chǎn)生它?;瘜W(xué)反應(yīng)設(shè)計(jì)與發(fā)現(xiàn)研究所 (ICReDD) 和北海道大學(xué)的前田小組的研究人員開發(fā)了一種方法,該方法可以僅使用以下信息預(yù)測多步化學(xué)反應(yīng)的“故事”(即起始材料和反應(yīng)路徑) “結(jié)束”(即產(chǎn)品分子)。
預(yù)測目標(biāo)產(chǎn)物分子的配方,除了分子本身之外沒有其他知識(shí),將是加速發(fā)現(xiàn)新反應(yīng)的有力工具。Maeda 小組之前開發(fā)了一種計(jì)算方法,成功地以這種方式預(yù)測單步反應(yīng)。然而,擴(kuò)展到多步反應(yīng)會(huì)導(dǎo)致可能的反應(yīng)途徑數(shù)量急劇增加——這就是所謂的組合爆炸。這種復(fù)雜性的急劇增加導(dǎo)致了高得令人望而卻步的計(jì)算成本。
為了克服這一限制,研究人員開發(fā)了一種算法,通過在反應(yīng)的每個(gè)步驟中丟棄不太可行的路徑來減少需要探索的路徑數(shù)量。在計(jì)算反應(yīng)中后退一步的所有可能路徑后,動(dòng)力學(xué)分析方法評估每條路徑產(chǎn)生目標(biāo)分子的程度。不產(chǎn)生高于預(yù)設(shè)閾值百分比的目標(biāo)分子的反應(yīng)路徑被認(rèn)為不夠重要,因此不會(huì)進(jìn)一步探索。
這種探索、評估和丟棄反應(yīng)路徑的循環(huán)在多步反應(yīng)中的每一步都重復(fù)進(jìn)行,并減輕通常會(huì)發(fā)生的組合爆炸,使多步反應(yīng)更易于計(jì)算。以前的方法僅限于單步反應(yīng),而這種新方法能夠預(yù)測涉及超過 6 個(gè)步驟的反應(yīng),標(biāo)志著能力的重大飛躍。
作為概念驗(yàn)證測試,研究人員在兩個(gè)眾所周知的多步反應(yīng)上測試了該方法,即 Strecker 和 Passerini 反應(yīng)。為每個(gè)反應(yīng)提出了數(shù)千種起始材料候選者,根據(jù)穩(wěn)定性和產(chǎn)物收率將其過濾為最有希望的候選者。至關(guān)重要的是,在所提議的候選材料中,每個(gè)反應(yīng)都使用了眾所周知的起始材料,這證實(shí)了該技術(shù)能夠僅從目標(biāo)產(chǎn)物分子中識(shí)別出實(shí)驗(yàn)上可行的起始材料。
盡管需要進(jìn)一步的工作來預(yù)測更大和更復(fù)雜的系統(tǒng),但研究人員預(yù)計(jì),處理多步驟過程的這一突破將加速新化學(xué)反應(yīng)的發(fā)現(xiàn)。
“這項(xiàng)工作提供了一種獨(dú)特的方法,因?yàn)檫@是第一次使用量子化學(xué)計(jì)算對多步反應(yīng)進(jìn)行反向預(yù)測,而無需使用任何有關(guān)反應(yīng)的知識(shí)或數(shù)據(jù),”前田聰教授說。“我們希望這項(xiàng)技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)完全無法想象的化學(xué)轉(zhuǎn)化,在這種情況下,幾乎沒有知識(shí)或?qū)嶒?yàn)數(shù)據(jù)可供使用。”
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