在對(duì)西尼羅河病毒的400多個(gè)不同基因組進(jìn)行測(cè)序后，一名NAU科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了位于科科尼諾縣的兩份西尼羅河病毒報(bào)告來(lái)自兩個(gè)不同的地方。一個(gè)人從鳳凰城地區(qū)向北遷移。另一個(gè)更像是個(gè)謎。

首先從整個(gè)美國(guó)西部的樣本到達(dá)進(jìn)化生物學(xué)家Crystal Hepp的實(shí)驗(yàn)室，該實(shí)驗(yàn)室與北亞利桑那大學(xué)信息學(xué)，計(jì)算機(jī)和網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)學(xué)院(SICCS)以及病原微生物學(xué)研究所(PMI)一起工作。她與整個(gè)西部的十幾個(gè)不同的公共衛(wèi)生部門合作。他們向她發(fā)送了在其所在地區(qū)發(fā)現(xiàn)的西尼羅河(WNV)樣本，她的團(tuán)隊(duì)對(duì)病毒基因組進(jìn)行了測(cè)序并分析了數(shù)據(jù)，以重建每個(gè)樣本的家譜，這使她能夠確定病毒如何隨時(shí)間推移以及在整個(gè)區(qū)域內(nèi)傳播。

在這種情況下，科科尼諾縣衛(wèi)生部門向她發(fā)送了兩個(gè)樣本，一個(gè)是在瑪麗湖的蚊子中發(fā)現(xiàn)的，另一個(gè)是在柴郡地區(qū)，兩個(gè)都是在8月下旬發(fā)現(xiàn)的。赫普對(duì)病毒株的基因組進(jìn)行了測(cè)序，并將其與她從其他地區(qū)測(cè)序的病毒株進(jìn)行了比較，發(fā)現(xiàn)這兩種病毒株并非由病毒的局部傳播所致，這意味著它們并未在禽類和蚊子之間傳播。縣。柴郡(Cheshire)菌株與馬里科帕縣(Maricopa County)傳播的菌株密切相關(guān)，而瑪麗湖(Lake Mary)菌株與其團(tuán)隊(duì)在2018年從蒙大拿州測(cè)序的菌株最密切相關(guān)，盡管瑪麗湖(Lake Mary)菌株顯示出與蒙大拿州菌株不同的幾種突變。

赫普說(shuō)，這是出乎意料的。對(duì)于科科尼諾縣來(lái)說(shuō)，這也是一件好事。

我們通常認(rèn)為最簡(jiǎn)單的答案就是最可能的答案。如果這兩個(gè)僅相距10英里的菌株是由于同一進(jìn)口事件??造成的，那將是有道理的。從公共衛(wèi)生的角度來(lái)看，發(fā)現(xiàn)這兩種菌株來(lái)自兩個(gè)不同的地方是個(gè)好消息。如果它們密切相關(guān)，則意味著西尼羅河病毒可能在科科尼諾縣10英里內(nèi)穿過(guò)鳥(niǎo)類和蚊子。我們希望這兩個(gè)單獨(dú)的介紹只是在發(fā)現(xiàn)的非常本地化的地理位置騎自行車，而不是跨越10英里，并且它們會(huì)逐漸消失。

赫普的實(shí)驗(yàn)室是努力更好地了解西尼羅河病毒如何在美國(guó)西南部傳播的領(lǐng)導(dǎo)者。她的公共衛(wèi)生伙伴進(jìn)行了初步診斷，然后向她發(fā)送毒株以確定該病毒是否起源。了解并繪制這些數(shù)據(jù)可以幫助政府更好地預(yù)測(cè)和準(zhǔn)備西尼羅河在其所在地區(qū)的可能性。這些合作伙伴包括：

馬里科帕縣環(huán)保服務(wù)媒介控制司

亞利桑那州衛(wèi)生服務(wù)部

尤馬縣滅蟲(chóng)區(qū)

Coachella谷區(qū)矢量控制

西南滅蚊與控制區(qū)

猶他州衛(wèi)生署

華盛頓州衛(wèi)生部

蒙大拿州公共衛(wèi)生與公共服務(wù)部

科科尼諾縣衛(wèi)生局

內(nèi)華達(dá)州南部衛(wèi)生區(qū)

這項(xiàng)研究包括本科生Daryn Erickson，Breezy Brock，Samuel Poidmore和Majesty Greer-Gipson，研究專家Jill Cocking，研究生Chase Ridenour，Krystal Sheridan和Heidie O'Neill(來(lái)自PMI測(cè)序核心)以及Darrin Lemmer，Mike Valentine和來(lái)自轉(zhuǎn)化基因組學(xué)研究所的Dave Engelthaler。

赫普說(shuō)：“我們對(duì)了解西南部傳播的菌株之間的連通性非常感興趣。” “例如，這使我們能夠確定馬里科帕縣的西尼羅河病毒情勢(shì)是在其他西南地區(qū)。來(lái)自馬里科帕縣的西尼羅河病毒在過(guò)去還蔓延到猶他州華盛頓縣，加利福尼亞河濱縣和亞利桑那州尤馬縣，我們希望繼續(xù)采用一種預(yù)測(cè)模型，該模型可以根據(jù)歷史模式和環(huán)境數(shù)據(jù)為各縣提供風(fēng)險(xiǎn)信息。”

自2010年以來(lái)，科科尼諾縣未報(bào)告西尼羅河地區(qū)的人類病例。

西尼羅河是該州最常見(jiàn)的蚊媒疾病，盡管其程度難以衡量，因?yàn)橹挥写蠹s20%的感染者甚至意識(shí)到自己生病了。大多數(shù)確實(shí)出現(xiàn)癥狀的人都感覺(jué)自己得了流感，但感染的人中約有150人中有1人患有嚴(yán)重的疾病，例如腦炎或腦膜炎，可能致命。

2018年，赫普獲得了亞利桑那州生物醫(yī)學(xué)研究中心的贈(zèng)款，用于調(diào)查該州西尼羅河的流通和源頭位置。

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